育苗温室大棚建设时施工过深，不光会增加了温室围墙的土方量，还需要大量的土堆放在大棚内，因此开挖越来越深，不利于蔬菜的生长。温室之所以可以用来种植反季节蔬菜（瓜、茄子、水果和其他温暖的蔬菜），是因为温室大棚可以为它营造适宜的温度和光照条件。这与温室日复一日接收阳光、在温室内储存热量、夜间散热的“温室效应”密切相关。
育苗温室大棚建设挖得太深的危害主要有两个方面：
一方面，不可规避地会导致大棚前出现一条长长的遮荫带。温室内温度（气温+地温）受阳光照射而升高，阴凉区的蔬菜会因低温而出现“低温屏障”。同时，由于光照不足，蔬菜不能正常进行光合作用，导致“黄瘦”，甚至“饿死”。
另一方面，建设者利用大棚内的成熟土筑墙后，表面是一层有机质含量低、土壤中缺乏有益微生物、透气性差的生土。如果不加以改造，将影响当季蔬菜的生长。另外， 育苗大棚建设下挖得太深，对于一些地下水位太浅的地区也不适合。如果大棚下的苗挖得太深，温室里种植的黄瓜会脱根、枯树，造成较大的经济损失。墙的内外坡不宜太陡。
一是墙体的里面坡度过陡或无坡度，使墙体的总表面积减小，进而减少墙体在白天的蓄热的能力。温室温度容易受影响，不利于蔬菜的正常生长发育。
二是东西墙的内坡太陡或没有坡度，所以白天早晚工棚内的光线很容易被东西墙遮挡。挡墙的时间和面积随挡墙坡度的减小而增加。温室光照不足会影响蔬菜的光合作用，减少蔬菜的产量和品质。另外，苗木温室墙的内外侧都有坡度，墙体呈梯形，可以增加其大棚的结实度。
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